Amidażi (AMD)
Enżimi:Huma katalisti bijoloġiċi makromolekulari, il-biċċa l-kbira tal-enzimi huma proteini
Amidażi:Ikkatalizza l-idroliżi ta' diversi amidi alifatiċi u aromatiċi endoġeni u barranin billi tittrasferixxi grupp aċil fl-ilma bil-produzzjoni ta' aċidi ħielsa u ammonja. L-aċidi idrossamiċi u aċidi organiċi oħra jintużaw ħafna bħala drogi għaliex huma kostitwenti ta' fatturi tat-tkabbir, antibijotiċi u inibituri tat-tumur. L-amidażi jistgħu jinqasmu f'aċilasi tat-tip R u tat-tip S skont l-istereoselettività tal-katalist.
Minbarra li tikkatalizza l-idroliżi tal-amidi, l-amidażi tista' wkoll tikkatalizza reazzjonijiet ta' trasferiment ta' aċili fil-preżenza ta' ko-sottostrati bħal idrossilamina.
L-amidażi b'sorsi differenti għandhom speċifiċità differenti għas-sottostrat, xi wħud minnhom jistgħu jidrolizzaw biss amidi aromatiċi, xi wħud minnhom jistgħu jidrolizzaw biss amidi alifatiċi, u xi wħud jidrolizzaw α- jew ω-amino amidi. Il-biċċa l-kbira tal-amini għandhom attività katalitika tajba biss għal amidi aromatiċi aċikliċi jew sempliċi, iżda għal aromatiċi kumplessi, l-amidi eteroċikliċi, speċjalment l-amidi b'sostituenti orto, ġeneralment huma baxxi fl-attività (ftit enzimi biss juru effetti katalitiċi aħjar).
Mekkaniżmu katalitiku:
| Enżimi | Kodiċi tal-Prodott | Kodiċi tal-Prodott |
| Trab tal-Enżima | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | sett ta' 19-il amidażi, 50 mg kull waħda 19-il oġġett * 50mg / oġġett, jew kwantità oħra |
| Kit tal-Iskrinjar (SynKit) | ES-AMD-1900 | sett ta' 19-il amidażi, 1 mg kull waħda 19-il oġġett * 1mg / oġġett |
★ Speċifiċità għolja tas-sottostrat.
★ Selettività kirali qawwija.
★ Effiċjenza għolja ta' konverżjoni.
★ Inqas prodotti sekondarji.
★ Kundizzjonijiet ta' reazzjoni ħfief.
★ Ma jagħmilx ħsara lill-ambjent.
➢ L-iskrinjar tal-enzimi għandu jsir għal sottostrati speċifiċi minħabba l-ispeċifiċità tas-sottostrat, u għandu jinkiseb enzima li jikkatalizza s-sottostrat fil-mira bl-aħjar effett katalitiku.
➢ Qatt m'għandek tikkuntattja kundizzjonijiet estremi bħal: temperatura għolja, pH għoli/baxx u solvent organiku b'konċentrazzjoni għolja.
➢ Normalment, is-sistema ta' reazzjoni għandha tinkludi sottostrat, soluzzjoni buffer (Il-pH ottimali tar-reazzjoni tal-enzima). Ko-sottostrati bħal idrossilamina għandhom ikunu preżenti fis-sistema ta' reazzjoni tat-trasferiment tal-aċil.
➢ L-AMD għandu jiżdied l-aħħar fis-sistema ta' reazzjoni bl-aħjar pH u temperatura ta' reazzjoni.
➢ It-tipi kollha ta' AMD għandhom diversi kundizzjonijiet ottimali ta' reazzjoni, għalhekk kull wieħed minnhom għandu jiġi studjat aktar individwalment.
Eżempju 1(1):
Attività ta' idroliżi għal Sottostrati ta' Amide differenti
| Sottostrat | Attività speċifika μmol min-1mg-1 | Sottostrat | Attività speċifika μmol min-1mg-1 |
| Aċetamide | 3.8 | ο-OH benżamid | 1.4 |
| Propjonamide | 3.9 | p-OH benżamid | 1.2 |
| Lattamide | 12.8 | ο-NH2benżamide | 1.0 |
| Butiramide | 11.9 | p-NH2benżamide | 0.8 |
| Isobutyramide | 26.2 | ο-Toluamide | 0.3 |
| Pentanamide | 22.0 | p-Toluamide | 8.1 |
| Eżanamid | 6.4 | Nikotinamide | 1.7 |
| Ċikloeżanamid | 19.5 | Iżonikotinamide | 1.8 |
| Akrilamide | 10.2 | Pikolinamide | 2.1 |
| Metakrilamida | 3.5 | 3-Fenilpropjonamide | 7.6 |
| Prolinamide | 3.4 | Indol-3-aċetamide | 1.9 |
| Benżamide | 6.8 |
Ir-reazzjoni twettqet f'soluzzjoni ta' buffer tas-sodium phosphate ta' 50mM, pH 7.5, f'70 ℃.
| Amidi | Idrossilamina | Idrażina |
| Aċetamide | 8.4 | 1.4 |
| Propjonamide | 18.4 | 3.0 |
| Isobutyramide | 25.0 | 22.7 |
| Benżamide | 9.2 | 6.1 |
Ir-reazzjoni twettqet f'soluzzjoni ta' buffer tas-sodium phosphate ta' 50mM, pH 7.5, f'70 ℃.
Konċentrazzjoni tar-reaġent relatata: amidi, 100 mM (benzamide, 10 mM); idrossilamina u idrażina, 400 mM; enzima 0.9 μM.
Eżempju 2(2):
Eżempju 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al. Bijokimika tal-Proċess, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al. Kimika Bijoorganika, 2017, Disponibbli online 7.
